مرکز تحقیقات سلامت مردان و بهداشت باروری

 

بررسی میزان بیان GAPLINC ، EIF1B.AS1 و TPT1.AS1 در جامعه ی آماری بزرگترو در نمونه ی خون افراد مبتلا، انجام آنالیزهای بیوانفورماتیک به منظور یافتن miR ها یا مکانسیم های مولکولی که در مسیرهای سیگنالینگ گوناگون در میزان بیان GAPLINC ، EIF1B.AS1 و TPT1.AS1 تاثیرگذار باشند از اهداف محققین برای دستیابی به بیومارکرهایی هرچند اختصاصی و دقیق برای تشخیص سرطان سه گانه منفی میباشد.

 

سرطان سینه سه گانه منفی TNBC) ) بسیار تهاجمی و متاستاتیک به غدد لنفاوی است. بنابراین، تشخیص بیومارکرهای جدید و مکانیسم‌های مولکولی متاستاز به غدد لنفاوی به عنوان اولین گام برای بررسی بیماری یک اولویت فوری است. RNA های طولانی غیر کد کننده lncRNAs) ) به طور گسترده در تومورزایی، پیشرفت و تهاجم سرطان مورد بررسی قرار گرفته اند. این مطالعه با هدف شناسایی و ارزیابی lncRNA ها در مسیر علامت دهی ژن MMP11 در نمونه های متاستاتیک و غیر متاستاتیک TNBC انجام شد. پتانسیل lncRNA ها در پیش آگهی و تشخیص بیماری نیز با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک، یادگیری ماشین و PCR کمی در زمان واقعی ارزیابی شد. با استفاده از الگوریتم‌های یادگیری ماشین، داده‌های موجود) BC ( Breast cancer را از اطلس ژنوم سرطان (TCGA) تجزیه و تحلیل کردیم و سه lncRNA بالقوه، مرتبط با آدنوکارسینوم معده، تنظیم‌کننده CD44 مثبت، RNA غیرکدکننده طولانی بین ژنی (GAPLINC)، TPT1-AS1 و آنتی‌سنس EIF1B را شناسایی کردیم. RNA 1 (EIF1B-AS1) می تواند با موفقیت بین موارد TNBC متاستاتیک و غیر متاستاتیک تمایز قائل شود. نتایج نشان داد که lncRNA GAPLINC در بافت‌های متاستاتیک BC، در مقایسه با نمونه‌های غیر متاستاتیک ( P<0.01) و نمونه‌های نرمال، افزایش بیان ، درحالیکه TPT1-AS1 و EIF1B-AS1 در نمونه‌های TNBC متاستاتیک بیان کاهش یافته دارند(P<0.01).

 

تأثیرات و کاربردها

با توجه به بیان نابجای lncRNA های کاندید و مکانیسم های اساسی، RNA های ذکر شده در بالا می توانند به عنوان نشانگرهای زیستی تشخیصی و پیش آگهی جدید در متاستاتیک این نوع سرطان پستان معرفی شوند.